Johannes Krause (Leinefelde, 17 de julio de 1980) es un bioquímico alemán que se centra en la investigación de enfermedades infecciosas históricas y la evolución humana. Desde 2010 es profesor de arqueología y paleogenética en la Universidad de Tubinga. En 2014, Krause fue nombrado codirector fundador del nuevo Instituto Max Planck para la Ciencia de la Historia Humana en Jena.